Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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LINC00587B1AMM8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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