Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms