Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEFF2Q9UIK5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEFF2Q9UIK5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEFF2Q9UIK5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms