Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHORDC1Q9UHD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHORDC1Q9UHD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHORDC1Q9UHD1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms