Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH2B1Q9NRF2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2B1Q9NRF2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms