Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,96■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18,96■□□□□ 0,63
Ap1s2Q9DB50 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,93■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,92■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18,91■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,62
Ap1s2Q9DB50 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18,89■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18,88■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,88■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,85■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18,85■□□□□ 0,61
Ap1s2Q9DB50 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,1 ms