Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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2010109I03RikQ9CQ11 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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2010109I03RikQ9CQ11 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2010109I03RikQ9CQ11 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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2010109I03RikQ9CQ11 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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2010109I03RikQ9CQ11 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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2010109I03RikQ9CQ11 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2010109I03RikQ9CQ11 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2010109I03RikQ9CQ11 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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2010109I03RikQ9CQ11 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2010109I03RikQ9CQ11 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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2010109I03RikQ9CQ11 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2010109I03RikQ9CQ11 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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2010109I03RikQ9CQ11 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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2010109I03RikQ9CQ11 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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2010109I03RikQ9CQ11 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2010109I03RikQ9CQ11 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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2010109I03RikQ9CQ11 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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2010109I03RikQ9CQ11 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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2010109I03RikQ9CQ11 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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2010109I03RikQ9CQ11 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
2010109I03RikQ9CQ11 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2010109I03RikQ9CQ11 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2010109I03RikQ9CQ11 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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2010109I03RikQ9CQ11 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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2010109I03RikQ9CQ11 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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