Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT11Q9BT88 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT11Q9BT88 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYT11Q9BT88 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT11Q9BT88 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms