Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TXNDC17Q9BRA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TXNDC17Q9BRA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms