Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF3Q96PU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF3Q96PU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3Q96PU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms