Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEURL3Q96EH8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEURL3Q96EH8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL3Q96EH8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL3Q96EH8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 449.1 ms