Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCN3Q96D15 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RCN3Q96D15 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCN3Q96D15 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms