Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBLCP1Q8WVY7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBLCP1Q8WVY7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBLCP1Q8WVY7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms