Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSRQ86X29 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSRQ86X29 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LSRQ86X29 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms