Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIAA0408Q6ZU52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIAA0408Q6ZU52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KIAA0408Q6ZU52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms