Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00114Q6XXX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINC00114Q6XXX2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00114Q6XXX2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00114Q6XXX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms