Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MED21-204ENST00000538186 552 ntTSL 35.27□□□□□ -1.571e-16■■■■■ 62
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PRPF8Q6P2Q9 PTPN9-204ENST00000564970 726 ntTSL 53.71□□□□□ -1.821e-16■■■■■ 62
PRPF8Q6P2Q9 MED21-202ENST00000536503 1374 ntTSL 1 (best)3.56□□□□□ -1.841e-16■■■■■ 62
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PRPF8Q6P2Q9 PROSER1-207ENST00000496138 418 ntTSL 30.62□□□□□ -2.311e-16■■■■■ 62
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PRPF8Q6P2Q9 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.374e-8■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.434e-8■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.654e-8■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.843e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 PHYH-204ENST00000453759 883 ntTSL 516.66■□□□□ 0.263e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 TRMT2B-204ENST00000478422 771 ntTSL 515.97■□□□□ 0.153e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 PHYH-205ENST00000463730 568 ntTSL 215.05■□□□□ 03e-16■■■■■ 60.7
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PRPF8Q6P2Q9 STRADA-215ENST00000580288 540 ntTSL 513.13□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 60.7
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PRPF8Q6P2Q9 CENPT-203ENST00000561593 673 ntTSL 412.68□□□□□ -0.383e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 APLP2-222ENST00000533860 1424 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.393e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.43e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 STRADA-235ENST00000639164 457 ntTSL 312.16□□□□□ -0.465e-9■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 TMEM68-208ENST00000520414 639 ntTSL 511.45□□□□□ -0.583e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-16■■■■■ 60.7
PRPF8Q6P2Q9 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-16■■■■■ 60.7
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