Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF8Q5VWM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF8Q5VWM4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF8Q5VWM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms