Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC4Q5J8M3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMC4Q5J8M3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMC4Q5J8M3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms