Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim71Q1PSW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim71Q1PSW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim71Q1PSW8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim71Q1PSW8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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