Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCK2Q16822 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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