Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1DQ13901 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1DQ13901 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1DQ13901 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1DQ13901 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1DQ13901 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1DQ13901 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1DQ13901 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1DQ13901 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1DQ13901 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1DQ13901 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1DQ13901 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1DQ13901 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1DQ13901 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1DQ13901 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1DQ13901 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1DQ13901 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1DQ13901 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1DQ13901 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1DQ13901 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1DQ13901 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1DQ13901 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1DQ13901 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1DQ13901 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1DQ13901 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1DQ13901 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1DQ13901 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1DQ13901 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1DQ13901 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1DQ13901 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1DQ13901 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1DQ13901 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1DQ13901 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1DQ13901 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1DQ13901 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1DQ13901 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1DQ13901 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1DQ13901 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1DQ13901 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1DQ13901 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1DQ13901 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1DQ13901 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1DQ13901 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1DQ13901 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1DQ13901 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1DQ13901 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1DQ13901 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1DQ13901 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1DQ13901 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1DQ13901 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1DQ13901 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1DQ13901 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1DQ13901 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1DQ13901 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1DQ13901 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1DQ13901 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1DQ13901 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1DQ13901 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1DQ13901 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1DQ13901 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1DQ13901 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1DQ13901 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1DQ13901 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1DQ13901 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1DQ13901 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1DQ13901 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1DQ13901 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1DQ13901 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1DQ13901 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1DQ13901 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1DQ13901 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1DQ13901 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1DQ13901 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1DQ13901 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1DQ13901 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1DQ13901 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1DQ13901 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1DQ13901 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1DQ13901 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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