Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A4Q13733 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A4Q13733 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A4Q13733 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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