Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 RBS1YDL189W 1374 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 FHN1YGR131W 525 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 YSC83YHR017W 1158 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 DYS1YHR068W 1164 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 YNL092WYNL092W 1203 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 RPL5YPL131W 894 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 PPM2YOL141W 2088 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 DOT1YDR440W 1749 nt6.87□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 PEX31YGR004W 1389 nt6.86□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 MPH3YJR160C 1809 nt6.86□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 CSM2YIL132C 642 nt6.86□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 ATG36YJL185C 882 nt6.86□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 AIM3YBR108W 2844 nt6.86□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 PPH22YDL188C 1134 nt6.85□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 TMA46YOR091W 1038 nt6.85□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 SLA2YNL243W 2907 nt6.85□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.84□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 ASR1YPR093C 867 nt6.84□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 PLB3YOL011W 2061 nt6.84□□□□□ -1.31
AVL9Q12500 DAL4YIR028W 1908 nt6.84□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 FCY22YER060W-A 1593 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 HGH1YGR187C 1185 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 HOC1YJR075W 1191 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 TOS6YNL300W 309 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 AAD14YNL331C 1131 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 OPI11YPR044C 354 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 ADH5YBR145W 1056 nt6.83□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 VTS1YOR359W 1572 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 STT3YGL022W 2157 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 FMP40YPL222W 2067 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 MRPL35YDR322W 1104 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 YHC3YJL059W 1227 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 YJR107WYJR107W 987 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 SWD1YAR003W 1281 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 PUS4YNL292W 1212 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 COQ1YBR003W 1422 nt6.82□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 CYS4YGR155W 1524 nt6.81□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 YKL102CYKL102C 306 nt6.81□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 GCN3YKR026C 918 nt6.81□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 YDR415CYDR415C 1125 nt6.8□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 YJL144WYJL144W 315 nt6.8□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 LIA1YJR070C 978 nt6.8□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 GFA1YKL104C 2154 nt6.8□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 YNL165WYNL165W 1221 nt6.8□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 SGE1YPR198W 1632 nt6.79□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 COX15YER141W 1461 nt6.79□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 ERG12YMR208W 1332 nt6.79□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 GPD1YDL022W 1176 nt6.79□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 YPT1YFL038C 621 nt6.79□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 ACO1YLR304C 2337 nt6.79□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 CRH1YGR189C 1524 nt6.79□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 HEM1YDR232W 1647 nt6.78□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 EDE1YBL047C 4146 nt6.78□□□□□ -1.32
AVL9Q12500 EHD3YDR036C 1503 nt6.77□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 YGR139WYGR139W 339 nt6.77□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 YKL077WYKL077W 1179 nt6.77□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 OPI8YKR035C 642 nt6.77□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 CUE4YML101C 354 nt6.77□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 SMK1YPR054W 1167 nt6.77□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 MIP1YOR330C 3765 nt6.77□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.76□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 RRN10YBL025W 438 nt6.76□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 LSC1YOR142W 990 nt6.76□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 MRPL23YOR150W 492 nt6.76□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 CIT3YPR001W 1461 nt6.76□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 COX10YPL172C 1389 nt6.75□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 HSP12YFL014W 330 nt6.75□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 HIS1YER055C 894 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 HEM2YGL040C 1029 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 LCL3YGL085W 825 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 RNH1YMR234W 1047 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 KSH1YNL024C-A 219 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 RFC4YOL094C 972 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 CCC2YDR270W 3015 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 FET4YMR319C 1659 nt6.74□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 YJR146WYJR146W 354 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 FBA1YKL060C 1080 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 MIA40YKL195W 1212 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 YAR064WYAR064W 300 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 OGG1YML060W 1131 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 EMP65YER140W 1671 nt6.73□□□□□ -1.33
AVL9Q12500 ECM38YLR299W 1983 nt6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms