Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 YMR253CYMR253C 1245 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 YPL257WYPL257W 582 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 PTC3YBL056W 1407 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 RGD2YFL047W 2145 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 OPI11YPR044C 354 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 SGF29YCL010C 780 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 HBN1YCL026C-B 582 nt6.27□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 OGG1YML060W 1131 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 KSH1YNL024C-A 219 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 POB3YML069W 1659 nt6.26□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 DID2YKR035W-A 615 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 YBR241CYBR241C 1467 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 EDE1YBL047C 4146 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 YPR196WYPR196W 1413 nt6.25□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 SRL2YLR082C 1179 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 RFS1YBR052C 633 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 ARE2YNR019W 1929 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 BNA3YJL060W 1335 nt6.24□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 HVG1YER039C 750 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 PRE3YJL001W 648 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 MIA40YKL195W 1212 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 COQ3YOL096C 939 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 DFR1YOR236W 636 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 DSF1YEL070W 1509 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 YNR073CYNR073C 1509 nt6.23□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 TAH11YJR046W 1815 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 MED6YHR058C 888 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 VPS24YKL041W 675 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 PTC4YBR125C 1182 nt6.22□□□□□ -1.41
VPS68Q12016 LPD1YFL018C 1500 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 PAC10YGR078C 600 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 GCN3YKR026C 918 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 ERG1YGR175C 1491 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YGR054WYGR054W 1929 nt6.21□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 AAT2YLR027C 1257 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 GTO3YMR251W 1101 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YNL190WYNL190W 615 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 MET30YIL046W 1923 nt6.2□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 CYB2YML054C 1776 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 RVB2YPL235W 1416 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 CCT3YJL014W 1605 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 MDE1YJR024C 735 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YJR084WYJR084W 1272 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 PSR2YLR019W 1194 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 FPR3YML074C 1236 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 RPS28AYOR167C 204 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 PPT1YGR123C 1542 nt6.19□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 SDH4YDR178W 546 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 GLC8YMR311C 690 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YNL120CYNL120C 486 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YNR014WYNR014W 639 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 TSR3YOR006C 942 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 ADH5YBR145W 1056 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 LDB16YCL005W 771 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 PMA2YPL036W 2844 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 AQR1YNL065W 1761 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 SLA2YNL243W 2907 nt6.18□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 HEM1YDR232W 1647 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YDR415CYDR415C 1125 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YPT1YFL038C 621 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YHL018WYHL018W 363 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 COX16YJL003W 357 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 ECM31YBR176W 939 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 PEX31YGR004W 1389 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 GNP1YDR508C 1992 nt6.17□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 RAD59YDL059C 717 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 TIM22YDL217C 624 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 HHY1YEL059W 309 nt6.16□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 MOG1YJR074W 657 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 ZRT2YLR130C 1269 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 TOS6YNL300W 309 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 ALR1YOL130W 2580 nt6.15□□□□□ -1.42
VPS68Q12016 CRF1YDR223W 1404 nt6.15□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 NTG1YAL015C 1200 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 MEH1YKR007W 555 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 MIP1YOR330C 3765 nt6.14□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 TOM71YHR117W 1920 nt6.13□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt6.13□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 YKR032WYKR032W 315 nt6.13□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 IVY1YDR229W 1362 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 HEM2YGL040C 1029 nt6.12□□□□□ -1.43
VPS68Q12016 YJR107WYJR107W 987 nt6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52 ms