Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC38A11Q08AI6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC38A11Q08AI6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms