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Protein–RNA interactions for Protein: P53202
CUL3, Cullin-3, yeast
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744 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CUL3
P53202
YER137C
YER137C
447 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
YHR213W-B
YHR213W-B
300 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
DPH5
YLR172C
903 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
YAR064W
YAR064W
300 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
YMR122C
YMR122C
375 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
YBR027C
YBR027C
333 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
YHR020W
YHR020W
2067 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
PPM2
YOL141W
2088 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
HAL5
YJL165C
2568 nt
7.1
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
YHC3
YJL059W
1227 nt
7.09
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
AQR1
YNL065W
1761 nt
7.09
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
NUP84
YDL116W
2181 nt
7.09
□□□□□ -1.27
CUL3
P53202
AIM2
YAL049C
741 nt
7.08
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
RRP9
YPR137W
1722 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
YEL075W-A
YEL075W-A
612 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
CUP2
YGL166W
678 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
MTR3
YGR158C
753 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
YLR463C
YLR463C
552 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
YOR012W
YOR012W
414 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
TAE1
YBR261C
699 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
ATG22
YCL038C
1587 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
COX10
YPL172C
1389 nt
7.07
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
IDP3
YNL009W
1263 nt
7.06
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
TDH2
YJR009C
999 nt
7.05
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
UIP5
YKR044W
1332 nt
7.04
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
CCT8
YJL008C
1707 nt
7.04
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
ZWF1
YNL241C
1518 nt
7.03
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
ATG36
YJL185C
882 nt
7.03
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
RDN5-2
RDN5-2
119 nt
7.03
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
RDN5-3
RDN5-3
119 nt
7.03
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
RDN5-4
RDN5-4
119 nt
7.03
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
RDN5-5
RDN5-5
119 nt
7.03
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
YML018C
YML018C
1182 nt
7.03
□□□□□ -1.28
CUL3
P53202
VMA3
YEL027W
483 nt
7.02
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
YFL013W-A
YFL013W-A
804 nt
7.02
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
CTF19
YPL018W
1110 nt
7.02
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
MCH2
YKL221W
1422 nt
7.01
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
YDR387C
YDR387C
1668 nt
7.01
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
MSP1
YGR028W
1089 nt
7.01
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
RFC4
YOL094C
972 nt
7.01
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
IRC11
YOR013W
471 nt
7.01
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
FSF1
YOR271C
984 nt
7.01
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
CDC13
YDL220C
2775 nt
7.01
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
POB3
YML069W
1659 nt
7
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
ERS1
YCR075C
783 nt
7
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
STT3
YGL022W
2157 nt
7
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
FAL1
YDR021W
1200 nt
6.99
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
ARC35
YNR035C
1029 nt
6.99
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
MSO1
YNR049C
633 nt
6.99
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
YPL257W
YPL257W
582 nt
6.99
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
HBN1
YCL026C-B
582 nt
6.99
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
RGD2
YFL047W
2145 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
YMR279C
YMR279C
1623 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)B
tG(GCC)B
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
SUF16
tG(GCC)C
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)D1
tG(GCC)D1
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)D2
tG(GCC)D2
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)E
tG(GCC)E
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
SUF20
tG(GCC)F1
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)F2
tG(GCC)F2
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)G1
tG(GCC)G1
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)G2
tG(GCC)G2
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)J1
tG(GCC)J1
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
SUF23
tG(GCC)J2
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)M
tG(GCC)M
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)O1
tG(GCC)O1
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
SUF17
tG(GCC)O2
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)P1
tG(GCC)P1
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
tG(GCC)P2
tG(GCC)P2
71 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
LYS1
YIR034C
1122 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
DID2
YKR035W-A
615 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
SCS7
YMR272C
1155 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
YMR295C
YMR295C
594 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
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YNL072W
924 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
SGF29
YCL010C
780 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
BNA3
YJL060W
1335 nt
6.98
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
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YOL016C
1344 nt
6.98
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CUL3
P53202
SMC5
YOL034W
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CUL3
P53202
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YDL188C
1134 nt
6.97
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
YJR146W
YJR146W
354 nt
6.97
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
RFS1
YBR052C
633 nt
6.97
□□□□□ -1.29
CUL3
P53202
PAC10
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600 nt
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□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
MPC2
YHR162W
390 nt
6.96
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
RUF23
RUF23
254 nt
6.96
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
DFR1
YOR236W
636 nt
6.96
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
CIR2
YOR356W
1896 nt
6.96
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
TAH11
YJR046W
1815 nt
6.95
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
AVO2
YMR068W
1281 nt
6.95
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
OPI11
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354 nt
6.95
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
YBR241C
YBR241C
1467 nt
6.95
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
PTC3
YBL056W
1407 nt
6.94
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
CSM2
YIL132C
642 nt
6.94
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
MRPL10
YNL284C
969 nt
6.94
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
EDE1
YBL047C
4146 nt
6.94
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
YEN1
YER041W
2280 nt
6.94
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
ARE2
YNR019W
1929 nt
6.93
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
CIT3
YPR001W
1461 nt
6.93
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
MIA40
YKL195W
1212 nt
6.93
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
SRL2
YLR082C
1179 nt
6.93
□□□□□ -1.3
CUL3
P53202
OGG1
YML060W
1131 nt
6.93
□□□□□ -1.3
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