Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.185e-7■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 AL390879.2-202ENST00000431464 646 ntTSL 228.33■■■□□ 2.135e-7■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.93□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-213ENST00000506889 1104 ntTSL 236.61■■■■□ 3.453e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-214ENST00000507384 572 ntTSL 435.2■■■■□ 3.233e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-224ENST00000514438 607 ntTSL 431.67■■■□□ 2.663e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-223ENST00000514283 619 ntTSL 231.67■■■□□ 2.663e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.343e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-222ENST00000513431 555 ntTSL 228.76■■■□□ 2.193e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-206ENST00000502678 693 ntTSL 427.97■■■□□ 2.073e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-209ENST00000505682 534 ntTSL 327.87■■■□□ 2.053e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-220ENST00000512695 549 ntTSL 425.27■■□□□ 1.643e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-208ENST00000504671 878 ntTSL 325.27■■□□□ 1.643e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-211ENST00000506269 564 ntTSL 424.18■■□□□ 1.463e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.443e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-207ENST00000504385 540 ntTSL 418■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MGAT1-225ENST00000514760 613 ntTSL 311.02□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 RNF213-207ENST00000559070 4644 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.392e-10■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 ANKRD10-210ENST00000494859 705 ntTSL 547■■■■■ 5.117e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.777e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)30.65■■■□□ 2.57e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.547e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 ANKRD10-203ENST00000460846 535 ntTSL 320.78■□□□□ 0.927e-8■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 35.6
HNRNPMP52272 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.13e-8■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.523e-12■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-211ENST00000458496 556 ntTSL 440.58■■■■■ 4.092e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-210ENST00000453170 594 ntTSL 539.8■■■■□ 3.962e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-207ENST00000427752 2475 ntTSL 230.91■■■□□ 2.542e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.32e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-208ENST00000434573 585 ntTSL 428.17■■■□□ 2.12e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.082e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.022e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.822e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.662e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 CHD7-204ENST00000526846 500 ntTSL 225.3■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 KMT5B-212ENST00000466295 638 ntTSL 222.07■■□□□ 1.122e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 CNOT6L-208ENST00000515506 4024 ntTSL 515.01□□□□□ -0.012e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-10■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-9■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 WNK2-212ENST00000467401 2258 ntTSL 223.2■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 218.33■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 35.5
HNRNPMP52272 PAPSS1-202ENST00000502431 903 ntTSL 533.63■■■□□ 2.971e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.061e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 PAPSS1-205ENST00000511304 927 ntTSL 313.63□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.142e-6■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.633e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.423e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.973e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 226.63■■□□□ 1.853e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.57■■□□□ 1.683e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.63e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 324.74■■□□□ 1.553e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)23.15■■□□□ 1.33e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 321.45■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 13e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)11.18□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 TYW1B-201ENST00000610600 1086 ntTSL 222.14■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 TYW1B-202ENST00000612372 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 PTPN18-213ENST00000489215 460 ntTSL 437.75■■■■□ 3.632e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 PTPN18-205ENST00000428843 785 ntTSL 334.57■■■■□ 3.122e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.442e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 PTPN18-212ENST00000483617 595 ntTSL 317.55■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 35.4
HNRNPMP52272 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.296e-16■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FUNDC2-205ENST00000484175 666 ntTSL 334.54■■■■□ 3.121e-12■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-12■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FUNDC2-204ENST00000475165 532 ntTSL 314.91□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FUNDC2-202ENST00000456179 871 ntTSL 314.44□□□□□ -0.11e-12■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FUNDC2-206ENST00000485289 726 ntTSL 514.44□□□□□ -0.11e-12■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FUNDC2-207ENST00000492303 3685 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FUNDC2-203ENST00000471528 765 ntTSL 36.45□□□□□ -1.381e-12■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 DDX39A-221ENST00000593026 657 ntTSL 323.1■■□□□ 1.296e-15■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 ADGRA3-205ENST00000504617 280 ntTSL 515.83■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 ADGRA3-201ENST00000282943 3534 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 BRF1-215ENST00000549655 1962 ntTSL 227.66■■■□□ 2.022e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.822e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 BRF1-220ENST00000552127 778 ntTSL 424.91■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.412e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.136e-7■■■■■ 35.3
HNRNPMP52272 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.218e-7■■■■■ 35.3
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 431.8 ms