Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA3P42263 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA3P42263 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms