Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 PRB1YEL060C 1908 nt6.72□□□□□ -1.33
UFE1P41834 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.71□□□□□ -1.34
UFE1P41834 YAR064WYAR064W 300 nt6.71□□□□□ -1.34
UFE1P41834 YML018CYML018C 1182 nt6.71□□□□□ -1.34
UFE1P41834 TUF1YOR187W 1314 nt6.71□□□□□ -1.34
UFE1P41834 COQ1YBR003W 1422 nt6.7□□□□□ -1.34
UFE1P41834 YDL177CYDL177C 513 nt6.7□□□□□ -1.34
UFE1P41834 YLR112WYLR112W 420 nt6.7□□□□□ -1.34
UFE1P41834 YHR020WYHR020W 2067 nt6.7□□□□□ -1.34
UFE1P41834 UIP5YKR044W 1332 nt6.7□□□□□ -1.34
UFE1P41834 COX10YPL172C 1389 nt6.69□□□□□ -1.34
UFE1P41834 TOD6YBL054W 1578 nt6.69□□□□□ -1.34
UFE1P41834 URH1YDR400W 1023 nt6.69□□□□□ -1.34
UFE1P41834 VMA3YEL027W 483 nt6.69□□□□□ -1.34
UFE1P41834 SNT309YPR101W 528 nt6.69□□□□□ -1.34
UFE1P41834 MSP1YGR028W 1089 nt6.68□□□□□ -1.34
UFE1P41834 QRI5YLR204W 336 nt6.68□□□□□ -1.34
UFE1P41834 AVO2YMR068W 1281 nt6.68□□□□□ -1.34
UFE1P41834 SCS7YMR272C 1155 nt6.68□□□□□ -1.34
UFE1P41834 FSF1YOR271C 984 nt6.68□□□□□ -1.34
UFE1P41834 PPM2YOL141W 2088 nt6.68□□□□□ -1.34
UFE1P41834 PAC2YER007W 1557 nt6.68□□□□□ -1.34
UFE1P41834 ZWF1YNL241C 1518 nt6.67□□□□□ -1.34
UFE1P41834 NUP84YDL116W 2181 nt6.67□□□□□ -1.34
UFE1P41834 ECM27YJR106W 2178 nt6.67□□□□□ -1.34
UFE1P41834 CIR2YOR356W 1896 nt6.67□□□□□ -1.34
UFE1P41834 RNH201YNL072W 924 nt6.67□□□□□ -1.34
UFE1P41834 AMN1YBR158W 1650 nt6.67□□□□□ -1.34
UFE1P41834 NTE1YML059C 5040 nt6.67□□□□□ -1.34
UFE1P41834 SNF4YGL115W 969 nt6.66□□□□□ -1.34
UFE1P41834 CTF19YPL018W 1110 nt6.66□□□□□ -1.34
UFE1P41834 CCT8YJL008C 1707 nt6.66□□□□□ -1.34
UFE1P41834 CEM1YER061C 1329 nt6.66□□□□□ -1.34
UFE1P41834 MRPL28YDR462W 444 nt6.65□□□□□ -1.34
UFE1P41834 YMR295CYMR295C 594 nt6.64□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YEN1YER041W 2280 nt6.63□□□□□ -1.35
UFE1P41834 MRPL10YNL284C 969 nt6.63□□□□□ -1.35
UFE1P41834 PPS1YBR276C 2424 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 PPH22YDL188C 1134 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 FAL1YDR021W 1200 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 MTR3YGR158C 753 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 ATG36YJL185C 882 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 MSO1YNR049C 633 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 RFC4YOL094C 972 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 SGF29YCL010C 780 nt6.62□□□□□ -1.35
UFE1P41834 DAL4YIR028W 1908 nt6.61□□□□□ -1.35
UFE1P41834 LYS1YIR034C 1122 nt6.61□□□□□ -1.35
UFE1P41834 AIM2YAL049C 741 nt6.61□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YPL257WYPL257W 582 nt6.61□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YMR279CYMR279C 1623 nt6.61□□□□□ -1.35
UFE1P41834 BNA3YJL060W 1335 nt6.6□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.6□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.6□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YOR389WYOR389W 1875 nt6.6□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YER137CYER137C 447 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 MPC2YHR162W 390 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 RUF23RUF23 254 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 YOR012WYOR012W 414 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 IRC11YOR013W 471 nt6.59□□□□□ -1.35
UFE1P41834 MCH2YKL221W 1422 nt6.59□□□□□ -1.36
UFE1P41834 STT3YGL022W 2157 nt6.58□□□□□ -1.36
UFE1P41834 BIM1YER016W 1035 nt6.58□□□□□ -1.36
UFE1P41834 QCR6YFR033C 444 nt6.58□□□□□ -1.36
UFE1P41834 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.58□□□□□ -1.36
UFE1P41834 DFR1YOR236W 636 nt6.58□□□□□ -1.36
UFE1P41834 TPK1YJL164C 1194 nt6.57□□□□□ -1.36
UFE1P41834 DID2YKR035W-A 615 nt6.57□□□□□ -1.36
UFE1P41834 YJR146WYJR146W 354 nt6.56□□□□□ -1.36
UFE1P41834 SRL2YLR082C 1179 nt6.56□□□□□ -1.36
UFE1P41834 OPI11YPR044C 354 nt6.56□□□□□ -1.36
UFE1P41834 HBN1YCL026C-B 582 nt6.56□□□□□ -1.36
UFE1P41834 PTC3YBL056W 1407 nt6.56□□□□□ -1.36
UFE1P41834 YPR196WYPR196W 1413 nt6.56□□□□□ -1.36
UFE1P41834 ARE2YNR019W 1929 nt6.56□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 MED6YHR058C 888 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 HMS2YJR147W 1077 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 COQ3YOL096C 939 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 DSF1YEL070W 1509 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 YNR073CYNR073C 1509 nt6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms