Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN2P35609 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ACTN2P35609 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACTN2P35609 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN2P35609 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms