Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCLP18206 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCLP18206 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCLP18206 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCLP18206 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCLP18206 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCLP18206 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCLP18206 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCLP18206 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCLP18206 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCLP18206 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCLP18206 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCLP18206 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCLP18206 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCLP18206 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCLP18206 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCLP18206 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCLP18206 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VCLP18206 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCLP18206 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCLP18206 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCLP18206 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCLP18206 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCLP18206 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VCLP18206 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCLP18206 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCLP18206 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCLP18206 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCLP18206 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCLP18206 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCLP18206 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCLP18206 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCLP18206 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCLP18206 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VCLP18206 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCLP18206 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VCLP18206 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCLP18206 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCLP18206 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCLP18206 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCLP18206 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCLP18206 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCLP18206 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCLP18206 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCLP18206 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCLP18206 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCLP18206 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCLP18206 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCLP18206 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCLP18206 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCLP18206 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCLP18206 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCLP18206 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCLP18206 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCLP18206 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCLP18206 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCLP18206 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCLP18206 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCLP18206 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCLP18206 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCLP18206 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCLP18206 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCLP18206 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCLP18206 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCLP18206 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCLP18206 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VCLP18206 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCLP18206 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms