Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga5P11688 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga5P11688 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga5P11688 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga5P11688 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga5P11688 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga5P11688 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga5P11688 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga5P11688 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga5P11688 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms