Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC2P02655 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC2P02655 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC2P02655 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC2P02655 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC2P02655 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC2P02655 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC2P02655 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOC2P02655 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOC2P02655 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC2P02655 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC2P02655 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC2P02655 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC2P02655 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC2P02655 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC2P02655 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC2P02655 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC2P02655 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC2P02655 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC2P02655 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC2P02655 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC2P02655 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC2P02655 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC2P02655 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC2P02655 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC2P02655 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC2P02655 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC2P02655 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC2P02655 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC2P02655 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC2P02655 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC2P02655 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC2P02655 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC2P02655 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC2P02655 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC2P02655 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC2P02655 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC2P02655 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC2P02655 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC2P02655 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOC2P02655 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOC2P02655 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOC2P02655 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC2P02655 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC2P02655 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC2P02655 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC2P02655 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC2P02655 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC2P02655 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC2P02655 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC2P02655 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC2P02655 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOC2P02655 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOC2P02655 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC2P02655 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC2P02655 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC2P02655 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC2P02655 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC2P02655 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC2P02655 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOC2P02655 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOC2P02655 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOC2P02655 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC2P02655 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC2P02655 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC2P02655 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC2P02655 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC2P02655 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC2P02655 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC2P02655 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC2P02655 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC2P02655 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC2P02655 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC2P02655 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC2P02655 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC2P02655 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms