Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGKV1-17P01599 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-17P01599 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-17P01599 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms