Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYPD3O95274 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYPD3O95274 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYPD3O95274 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD3O95274 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms