Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
JRKO75564 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JRKO75564 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
JRKO75564 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JRKO75564 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JRKO75564 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
JRKO75564 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
JRKO75564 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JRKO75564 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JRKO75564 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JRKO75564 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
JRKO75564 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JRKO75564 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JRKO75564 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
JRKO75564 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JRKO75564 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JRKO75564 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
JRKO75564 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JRKO75564 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JRKO75564 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
JRKO75564 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JRKO75564 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JRKO75564 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
JRKO75564 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
JRKO75564 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
JRKO75564 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
JRKO75564 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JRKO75564 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JRKO75564 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
JRKO75564 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JRKO75564 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
JRKO75564 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
JRKO75564 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JRKO75564 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
JRKO75564 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JRKO75564 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
JRKO75564 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
JRKO75564 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JRKO75564 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
JRKO75564 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
JRKO75564 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JRKO75564 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
JRKO75564 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JRKO75564 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JRKO75564 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
JRKO75564 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JRKO75564 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JRKO75564 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JRKO75564 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JRKO75564 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
JRKO75564 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
JRKO75564 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JRKO75564 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
JRKO75564 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JRKO75564 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
JRKO75564 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JRKO75564 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JRKO75564 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
JRKO75564 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JRKO75564 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JRKO75564 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
JRKO75564 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JRKO75564 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
JRKO75564 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JRKO75564 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JRKO75564 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JRKO75564 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JRKO75564 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JRKO75564 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JRKO75564 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JRKO75564 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JRKO75564 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JRKO75564 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JRKO75564 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
JRKO75564 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
JRKO75564 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
JRKO75564 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
JRKO75564 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JRKO75564 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
JRKO75564 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
JRKO75564 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JRKO75564 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JRKO75564 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JRKO75564 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JRKO75564 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
JRKO75564 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JRKO75564 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JRKO75564 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JRKO75564 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JRKO75564 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JRKO75564 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms