Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2K7ER74 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms