Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB8E9PQR5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB8E9PQR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB8E9PQR5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB8E9PQR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms