Protein–RNA interactions for Protein: D3YYH9

Gm498, Predicted gene 498, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm498D3YYH9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm498D3YYH9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm498D3YYH9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm498D3YYH9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms