Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEMP2A6NFY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMP2A6NFY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMP2A6NFY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEMP2A6NFY4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms