Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQ87 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQ87 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQ87 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms