Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF6Q9Y4K3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms