Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT52Q9Y366 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT52Q9Y366 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms