Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms