Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms