Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms