Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms