Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3Q9UJ98 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms