Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms